Padaliniai
- Direkcija
- Dokumentų konservavimo ir restauravimo skyrius
- Fondų ir vartotojų aptarnavimo skyrius
- Informacijos skyrius
- Informacinių sistemų skyrius
- Katalogų skyrius
- Komplektavimo skyrius
- Leidybos skyrius
- Rankraščių skyrius
- Retų spaudinių skyrius
- Skaitmeninimo skyrius
- Ūkio skyrius
- Skyrius Fizinių ir technologijos mokslų centro Chemijos institute
- Skyrius Gamtos tyrimų centro Botanikos institute
- Skyrius Gamtos tyrimų centro Ekologijos institute
- Skyrius Gamtos tyrimų centro Geologijos ir geografijos institute
- Skyrius Lietuvos kultūros tyrimų institute
- Skyrius VU Biochemijos institute
- Skyrius VU Matematikos ir informatikos institute
- Skyrius VU Teorinės fizikos ir astronomijos institute